蜂疗对风湿性关节炎、感冒等多种疾病有效，但并非人人皆宜，如患有结核性疾病、严重肾脏病、传染性肝病、先天性心脏病（风湿性心脏病除外）、严重糖尿病等疾病人群，应禁止使用。
此外，孕妇、哺乳期妇女、女性经期、老年人、10岁以下的幼童要慎用；在疲劳、饥饿，心、肝、肾功能较差，体质虚弱等状况下，也应避免使用。值得注意的是，蜂疗期间，不能使用醇类或其他外用药以及服用含虫类的药物，禁食辛辣热性食物及油炸食物，严禁大量饮酒，以免引起严重过敏反应。
蜂疗前，需进行过敏试验，即将活的蜜蜂蜇足三里、外关两个穴位（只两三秒钟就迅速将刺拔出），观察20～30分钟，如果不出现全身过敏症状，即可用蜂疗。如果全身出现皮疹等过敏症状，那么服用抗过敏药物后症状会消失，对于会出现过敏的病人一般不适宜做蜂疗。不过有些出现过敏症状的病人下次再被蜜蜂蜇时，会脱敏，也就是说下次蜇可能就适应了。
如果蜂蜇后红肿面积比较大，甚至出现全身剧痒、风疹时，切莫惊慌。这时可先服一杯蜂蜜水，局部用5%的酒精搽患处一般即可缓解。如局部瘙痒影响睡眠，可服用扑尔敏，瘙痒处适当搽点清凉油。如果被蜂蜇后出现小黄水疱，不要用针将其挑破，以免引起感染发炎，应让其自行好转。
