鱼腥草别名“侧耳根”、“猪鼻孔”，鱼腥草入药具有清热解毒、消痈排脓、利尿通淋的作用，在我国传统医学中具有较为广泛的应用。常与芦根、桔梗、瓜蒌等同用于肺痈吐脓，痰热喘咳。用于热毒疮疡时，可与野菊花、蒲公英、金银花等同用，亦可单用鲜品捣烂外敷。若皮肤瘙痒，蚊虫叮咬，疔疖红肿痒痛，亦可单用本品制成搽剂，外涂患处。鱼腥草用于膀胱湿热，小便淋漓涩痛时，常与车前子、白茅根、海金砂等同用；亦可单用鱼腥草，不仅治疗热淋，尚可治疗白浊及白带。用于大肠湿热、泄泻痢疾时，多与黄连、黄柏、白头翁等配用，也可与山楂炭配伍，治疗热痢。
现代药理实验表明，鱼腥草具有抗菌、抗病毒、提高机体免疫力、利尿等作用。临床广泛用于治疗肺炎、咯血、上呼吸道感染、慢性支气管炎、百日咳、流感、肺脓疡、癌性胸水、感冒发烧、肺癌、宫颈糜烂、化脓性关节炎、习惯性便秘、急性细菌性痢疾、急性黄疸性肝炎、肾病综合征、单纯疱疹性角膜炎、鼻炎、化脓性中耳炎、流行性腮腺炎、丘疹状荨麻疹、慢性咽炎、肛肠病、前列腺炎、红斑狼疮、血管瘤、预防钩端螺旋体病等。
以鱼腥草为主药的便方可供医生选用。治疗肺脓疡：鱼腥草30g，桔梗15g，水煎服或研末冲服；治疗痢疾：鱼腥草20g，山楂炭6g，水煎加蜂蜜服；治疗流行性腮腺炎：新鲜鱼腥草适量，捣烂外敷患处，以胶布包扎固定，每日2次；治疗急性黄疸性肝炎：鱼腥草180g，白糖30g，水煎服，每日1剂，连服5～10剂。
