1.皮肤 在儿童用药不良反应和意外中，皮肤损害最常见，皮疹、红斑、水肿等皮肤损害是最常见的表现。
2.胃肠 口服给药常会导致儿童胃肠道损害，静脉滴注和肌肉注射的方式也可以造成胃肠损害。胃肠系统的损害主要表现为胃肠道的不良反应，如腹泻、胃痛、恶心等。
3.肝胆 新生儿肝脏对外来物质代谢能力较弱，若超剂量、合用药物或乱用中草药，可能导致药物性的肝损害，导致肝功能异常，出现厌食、黄疸等症状。
4.泌尿 新生儿肾功能的成熟过程需要8~12个月才能达到成人水平，很多家长在儿童感冒咳嗽稍微有些体热时就使用解热镇痛药，造成肾脏损伤、肾小管损害、血尿等。国内外已有数据表明，多黏菌素、去甲肾上腺素能引起儿童的肾脏损伤，感冒通能引起儿童血尿。
5.全身 全身性损害主要表现为过敏性休克、过敏样反应、发热、寒战、红颈综合征等。
6.血液 解热镇痛药、镇静剂、抗结核药、抗癫痫药等，药物本身或使用不当都对小儿血液系统有损害。
