医院组织工作的主要目的，是使医院干部职工能更加有效地合作，医院组织工作与其他组织工作一样，也有一个过程问题。从一家企业的组织过程图可以看出，医院的组织过程应当包括如下6个步骤：
1.确定医院的总体目标；
2.制定支持性的目标、政策和计划；
3.明确为完成上述目标、政策和计划所必需的活动，并加以分门别类；
4.根据现有的人力、物力，并根据环境来使用人力和物力的最佳方法，把上述活动划分成各个组。如医疗组、保健组、预防组、科研教学组等，各组又可细分为数个科室；
5.给各个组的领导人授予要完成活动所必需的权力；
6.通过职权关系和信息流通，建立医院各项汇报、转诊、会诊、质量考核、业绩考评、服务监督等制度，横向和纵向交错地把各个组联系起来，形成医院组织的有机总体。
工作职能
在上述组织过程的基本框架下，医院组织工作可看成：一是明确医院的诊疗活动并加以分类；二是对为实现目标所必要的活动分组；三是授权；四是为医院组织结构的横向协调与纵向协调制定有关规定。
具体而言，医院组织工作的基本职能主要表现在以下几个方面。
1.充分发挥组织功能
组织系统是以人为主体的社会系统，该系统的特征是强调目标、整体、责任和效率。
为使医院整个系统顺利运转起来，良好的组织工作是必不可少的。它能使医院每一个成员充分认识到自己所从事的工作对实现医院的目标有着重要作用，从而能够保质保量地完成任务，带来医院组织的高效率和高效益，促进医院组织整体的发展。同时，医院组织的发展，也能满足成员自身的物质需要和精神需要，使其更加主动地为实现医院组织的目标而努力工作。
2.协调各种关系
组织具有整体性，讲究分工协作。医院作为一个总体，只有通过组织工作，才能划分和沟通上下左右各种关系。这样不但能使医院各类医务人员、技术人员及管理人员明确自己在医院组织中的工作关系和隶属关系，并且能够处理好这些关系，从而处理好人、才、物等方面的复杂关系，以便创造更好的社会效益与经济效益。
3.促进组织的革新与完善
现代医院管理十分重视不断改善医院组织的结构，这不仅在于提高管理效率，更重要的是关系到医疗机构改革的成败。因为组织总是处于一定的社会系统中，医疗机构也不例外——它必须同外界环境不断进行能量、信息、物质的输入和输出，而这种交换势必影响到医院组织的目标。
医院组织必须根据外界环境的变化不断修正自己的目标。通过组织工作，则可随时调整、改善医院的组织结构，使其更加合理，也使医院各部门的职责范围更加明确，不断适应客观环境的变化与发展。
组织工作作为一个过程，它有基本的逻辑（如下图所示）。其中，第一步和第二步实际上属于计划过程。
