在具体实践中，供应链整合的主导者多是业界的龙头企业和投资机构，资本成为推动供应链整合的力量。供应链整合的主导者往往为了增加对供应链的控制，通过兼并行为而形成拥有完成产业资源的企业巨头；如国药集团、上药集团、太极集团、通用医药不仅收购商业公司，也将生产企业、科研单位收入囊中，使供应链的节点单位关系更加密切，提升整体供应链竞争力。
目前各地市级的拥有终端网络和政府资源、产权结构清晰、无不良记录的商业公司，以及拥有独特产品、具有市场开发潜力、临床需求大的生产企业都成为了兼并收购的主要对象，PE已经达到了15-20倍。
如上所述，供应链整合将带动医药行业格局和经营模式的转变，将出现一些新的市场机会和投资方向，参股、控股将成为主要的手段，主要包括：
一是物流信息技术服务。能够提供行业供应链整合整体解决方案的医药信息服务公司会产生，领导型的商业公司将成为其中的主力军，专门从事医药物流信息研究的IT公司也将带来巨大的发展机会，医院物流项目将成为热点，以技术换份额成为信息技术服务投入的原动力。
二是收购拥有专利技术、新特药品，以原料、制剂、中药生产为主的优质企业将成为供应链向上延伸的主要路径，新药研发型企业也将成为供应链投资的重点。
三是区域性的拥有终端网络、销量、规范的流通企业和连锁企业将成为投资收购的重点，其中包括省级企业和地、市、县级企业。
四是顺应公立医院改革思路，收购医疗机构将成为供应链向下延伸的路径，用资金换渠道和份额是供应链整合的主要目的。
五是生产企业产品出让销售权给供应链成员，流通企业定制销售生产企业产品，政府定点生产、统一供应也将成为供应链的投入方向。
六是随着集中度的提高，流通领域企业间的分销协作将更加紧密和规范，供应链联盟的线条将越来越清晰。
