这几年的药店培训市场可谓热闹异常。各路人马、众多培训机构大量涌现，“军阀混战”，良莠不齐。加上一些组织上的问题，还有员工个人学习积极性等原因，使得培训效果很难保证。出现这些问题的原因主要有以下几点：
店员缺乏参加培训的积极性 这一方面与店员的职业规划有关，很多店员没有想通过培训，来培养或者提升自我的能力，来实现自我价值。另一方面，也是主要的方面，是培训内容与店员的需求不配套，培训方式陈旧，无法激起学员的积极性。近年来，一些专业培训机构试图通过创新培训模式来解决这一问题。如中国药店管理学院提出的“现场演练培训”概念，通过教与学高度互动，提高店员的观察能力、表达能力和实操能力，让店员在培训中发现实际工作中容易被忽视的问题，从而提高店员参与培训的积极性。
培训计划及相关制度不系统 很多连锁药店虽然制订了培训计划，但是这些计划不具体、不系统，没有按照年度、季度和月度进行分解，甚至没有明确的培训主题，课程设计事先不征求员工意见，员工没有选择余地。这样势必会严重影响培训效果。
培训师队伍整体素质有待提高 目前国内零售药店培训市场中非药店行业的从业者居多，且援引的案例均以原从事业态（快销、直销专卖或批发业态）为主，未能有针对性地面对药店的需求。有很多给药店做培训的往往只做销售技巧、中高层管理方面的培训，缺乏行业内权威数据、信息的支持，效果当然会大打折扣了。
