医保控费和消除“以药养医”，归根结底将促进医疗资源的合理配置和严格规范临床药物使用，从而使药品市场容量得到合理控制。在需求优化的趋势下，势必形成药品资源的优胜劣汰，加速国内药企整合。
目前国内有6000多家药企，4900多家GMP生产车间，但行业创新能力弱，生产格局小、散、乱的现象突出，部分药品产能过剩严重。高端药物和专利药物研发能力不足，企业便在低端市场过度竞争，在大处方、大检查和过度医疗频繁出现的“以药养医”时代，药企与医院产生利益共鸣，加剧了患者和财政支出，部分中小药企在研发方面也驻足不前。
这种行业格局与深化医改的目标背道而驰。在基本药物招标体系中，部分中小药企恶意竞标现象突出，依靠低廉的成本优势将大型药企从一些省份的基药竞标中挤出，但竞标成功后由于生产能力不足，依然无法保证药品的高效、安全供应；在抗菌药物临床使用中，散、乱的利益格局和“以药养医”共同推动抗菌药物的过度使用，政府只得出台《抗菌药物临床应用管理办法》进行监管。在此背景下，虽然国内有6000多家药企，却依然不时出现鱼精蛋白、凝血酶原复合物匮乏等现象。总结来看，唯有医改与“药改”齐头并进，“十二五”深化医改的目标才能取得更好成绩。
医保支付方式改革无疑是打破原有行业格局的途径之一。医院告别“以药养医”、增强节约成本意识后，药品质量评价体系有望快速建立，药效最好、性价比最高的药物将受到重视。而“以医养医”的探索和药品市场化定价趋势的建立，也将推动不同品质的同类药品出现优胜劣汰，减弱地方药企保护现象，打破高价药受宠、廉价救命药缺失的怪局。
在此基础上，药品需求将实现“软着陆”，基本药物招标程序有望优化、过度用药现象将得到抑制，市场格局有望向规模大、效率高、研发能力强的大中型药企倾斜，进而增强国内医药行业研发实力。而药品需求的“软着陆”，也将倒逼国内药企“走出去”，推进与跨国药企合作，加快制剂产品出口，增强对心脑血管、糖尿病等慢性病药物和部分抗肿瘤、非医保类高端药物以及生物技术药物的研发，带动国内医药产业升级，实现战略新兴产业发展的定位。
但值得重视的是，须避免把医保控费的风险转嫁到医疗机构，医疗机构再将成本控制的压力转嫁到药企，使医药企业正常发展遭受打击。主管部门应注意到，在大力推动医保支付方式改革、医药分开和去除“以药养医”的同时，应该快速完善多渠道财政补偿机制，加快对医务工作者绩效评价的完善和医疗服务的市场化改革。
