要使一家药店运营良好，各部门必须做好本职业务工作。一般而言，药店业务可划分为卖场运营与商品业务以及其他业务三大块。其中，卖场运营与商品业务可细分为以下几项业务：
★订货业务 一个运营良好的卖场，前提应确保在售商品有一定的备货，以满足顾客需求。药品零售行业的订货方法以定期订货法为主，即规定订货时间为固定的时段，每次根据情况决定订货数量，或按最大库存量进行订货。
★验收业务 在确认了供应商交货的商品与交货单据的数量相符、质量无问题的基础上，药店相关部门予以接收。确认交货后，验收者在交货单据上盖验收印或签字，并记下日期。验收后，商品的所有权就从供应商手中转至药店企业，从这一刻起，药店也有了支付货款的义务。连锁药店一般拥有物流中心，验货工作基本在物流中心完成，连锁旗下的各门店基本实施“不验收”方针。
★单据管理 单据管理是管理零售业与交易对方确定债权、债务根据的文件。这种单据通常由验收人员确认内容后，在药店或连锁总部进行输入作业，以确定债权、债务。
★库存管理业务 库存管理是为了适度、合理地保有商品库存。若库存过多，就会产生资金周转与商品过期等问题；库存过少，又会错失销售良机。因此，相关部门不仅要依据以往的商品销售数量，还应调查、收集目前的商品动态与信息，以便更合理地订货及处置商品。
★补货陈列业务 定期进行补货陈列可提高店内商品的丰满性，防止缺货。
★防损管理业务 防损管理是为了最大限度地预防企业产生损耗情况，主要分为以偷盗为代表的外部因素损耗，以店员自盗为代表的内部损耗，以及店员与外部人员里应外合导致的损耗。
★服务业务 主要指店员接待顾客时提供的服务。在药店，待客服务的优劣决定销售业绩好坏的事例不胜枚举。
★收银业务 收银重点在于准确、快速以及提供良好的付款体验。收银台是顾客在药店停留的最后场所，良好的付款体验是吸引顾客再次来店的因素之一。
★效期管理 效期管理也是降低损耗的重要措施，更是向顾客提供安全、放心商品的必然要求。顾客对于效期也会以警惕的目光进行审视，若商品逾期在售，不仅会令药店失去顾客的信任，还可能导致有关部门的查处。因此，药店必须制定效期管理制度，彻底落实“先进先出”原则，严格地定期进行商品管理。
★盘点管理 盘点管理有4个目的：算出损耗金额；通过盘点金额，算出某一时期的利润；确定商品库存；进行商品评价。盘点工作因药店规模的不同而有所差别。一般而言，大型连锁药店通常在1周前就要做好准备工作。首先，整理库存。可以将已在卖场陈列的同一商品全部出货至卖场陈列，这段时间内不再订货增加库存，整理库存有利于统计工作；同时把商品陈列在店内货架顶端的上方，为盘点创造了容易操作的环境。通过事先整理，可以及时处理近效期、失效期的商品。其次，在盘点当天，做好进程表与作业分配表尤为重要。不宜追求盘点速度，而应追求盘点的准确性。准确性与利润、库存金额、损耗密切相关。
★保洁业务 保持店面洁净能给顾客留下好印象，这是最基本的形象要求。
