北京友谊医院等5家试点医院医药分开改革至今已有两年多的时间，从北京市医管局对改革监测的情况看，试点医院运行平稳，改革彻底切断了医院与药品的利益关联，改变了医院的补偿渠道，促进了医院的合理用药，更为重要的是带动了试点医院的综合改革。
截止2014年10月底，试点医院与改革前的2012年上半年相比，总体药占比从46.12%下降到36.20%；门诊医保病人药占比从70.04%下降到58.16%，次均医疗费用从429 元下降到374 元，下降了55元；次均药品费用从301元下降到217元，下降了84元；住院医保病人药占比从30.87%下降到23.81%，例均医疗费用从17825元下降到16026元。但由于存在药品价格“洼地效应”，通过对改革的追踪也发现，试点医院普通门诊就诊人次异常增多，在一定程度上倒吸了基层患者。针对改革出现的相关问题，北京市医管局在加强改革监控的同时，积极配合北京市医改办等相关部门，进一步完善北京市的公立医院改革试点方案，推动医药分开改革在北京全市尽快推开。
