现代化物流体系
早在2001年，九州通就开始进行现代医药物流流程以及相关物流技术的研究，并与国内外先进的物流集成商进行技术交流，探索将国内外先进的物流技术与中国医药物流的具体国情相结合的物流模式。
九州通积极引进哈佛大学、麻省理工学院、清华大学、日本一桥大学、武汉大学等知名学府毕业的优秀人才，组建了业内顶尖的物流技术研发与物流管理团队。公司现有医药物流技术研发人员和物流管理人员约400多人。在10年时间里，九州通共规划建设投资了34个医药物流中心并已投入使用。公司在国内医药物流行业中的现代物流技术和信息技术的运用方面保持了领先的优势，是中国目前唯一具备独立集成规划现代医药物流中心能力和拥有自主知识产权的现代医药物流企业。
基于九州通在现代医药物流技术和信息技术运用方面所取得的成绩，2008年11月28日，在全国16家荣获“中国物流改革开放30年旗帜企业”称号的企业中，九州通是全国一万多家医药商业企业中唯一获此殊荣的企业。
销售能力强大
据中国医药商业协会统计，九州通医药集团在全国上万家医药商业企业中位列第三名，在民营医药商业企业中位列第一名，2006－2008年公司市场占有份额分别为3.83%、3.96%和4.05%，呈现逐年上升的良好趋势。
市场份额的提高主要得益于公司强大的销售能力。九州通现已建立起全国性的销售网络，是现有全国医药商业企业中销售网络覆盖面最广的企业之一，具有销售网络的广度与深度优势目前，我国制药企业在产品、价格乃至广告同质化趋势加剧的形势下，单凭产品优势赢得竞争和利润愈发困难。各制药企业都在设法减少中间环节，降低销售费用，规避经营风险，并谋求统一的销售渠道使产品尽快接触到广大的消费者。
另外，九州通的省级医药物流中心、地市级物流中心和下设办事处的营销网络已经覆盖了中国大部分的行政区域，构成了全国性网络。九州通是全国1万多家医药流通企业中营销网络覆盖区域最广的企业之一，也是唯一具有全国性营销网络的大型民营医药商业流通企业。
除九州通和国药控股外，中国其他的医药商业流通企业均属于区域性或地方性的企业，销售网络只限于所在区域和一些周边省份。因此，九州通为药品生产企业的服务功能明显优于其他区域性的同类企业，也可容易获得上游生产厂家给予的有别于其他区域性同类企业的优惠销售政策。