从西部落后地区到东部发达地区，几乎所有基层医疗卫生机构都缺全科医生。据卫生部提供的数据显示，我国注册的全科医生仅有7.8万名。亦有媒体调查发现，目前各地全科医生基本上是在岗简单培训几个月，而且起始学历较低，尤其是中西部地区，往往以中专、大专学历的居多。
近段时间，北京、上海等大城市也频频传出“缺全科医生”的消息。为什么过去不缺，现在突然就缺了呢？今年 6月，《国务院关于建立全科医生制度的指导意见》发布，明确要求“到2012年，每个城市社区卫生服务机构和农村乡镇卫生院都有合格的全科医生；到2020年，要基本实现城乡每万名居民有2~3名合格的全科医生。”而事实上，在培养全科医生方面，各地政府还没有做好充分准备。
从以上数据可以看出，全科医生不但在数量上缺口极大，在质量上同样有欠缺。现在的问题是，地方政府如何消解“双缺”之痛？从各地实践看，地方给出了各种不同的答案。
按照国家指导意见提出的统一标准，全科医生培养将逐步规范为“5+3”模式，先接受5年的临床医学本科教育，再接受3年的全科医生规范化培训。现阶段，不少地方还远未能达到这一步。在追求一时政绩的冲动下，学历低的社区医生有可能被送出去简单培训几个月，回来后就挂牌成为“全科医生”，这显然是急功近利的行为。这样注水而来的“全科医生”，能否提供令公众满意的全科医疗服务，值得怀疑。
在社区医疗机构及医疗服务建设上，不仅要抓数量，质量也时刻不能放松。不是硬件的问题，而是软件升级改造的问题。建立全科医生制度，其根本目的正是源于后者的需求，难也难在后者。建一所标准化的社区卫生服务中心可能只需要几个月时间，但要培养1名合格的全科医生，则可能需要花费8~10年的时间。
在全科医生建设方面，如果缺乏严格的准入机制，缺乏统一的培训标准，缺乏足够耐心的投入产出机制，只是单纯在数字上发力，走“大跃进”式的高速发展路线，在短时间内建成一支庞大的全科医生队伍不是难题，但问题是，这样的服务体系能否令公众满意，实现病源分流，并承担起首诊在基层的重担？
过去，因为基层医疗人力培养与投入的失衡，导致了大医院及社区医疗机构之间服务质量的巨大差距，才出现了“大医院情结”。在全科医生制度实施过程中，希望错误不会重现。