按照我国现有政策规定，目前大力推行的基本药物制度必须实行统一配送。由于各地的经济发展水平不均衡、医疗改革推行的进程不一致以及流通企业的改革发展状况不尽相同等原因，对基本药物的配送上出现了几种不同的模式，各具特色，也各有利弊。
集中配送
优：准入门槛高，扶优汰劣
劣：配送覆盖受限，资源配置欠合理
所谓集中配送模式，是指省一级政府制定统一标准，通过公开招标的形式，在每个市择优遴选3家左右的配送企业，对基本药物实行统一配送。如陕西省共遴选了16家配送企业，承担着99个县1699个乡镇卫生院、22000多个村卫生室的基本药物配送任务，今年配送任务还要扩展到县级医院。
这种集中配送模式的优势在于：根据统一标准，通过招标形式，更多地选择了一些销售规模大、资金实力强的省一级公司的大企业作为配送企业。弊端在于：一是这些大企业原来的服务对象都是以大型公立医院为重点，经营策略是搞大品种总经销总代理，销售方式是签品种少、数量多的大订单生意，而对县级以下的乡镇卫生院、村卫生室这些网点分散、采购量小、送货频繁的医疗机构配送不适应，因而出现了覆盖面不够广、配送率不够高、送货不及时等问题。二是由于送货半径大、距离长、路途遥远，以省会城市为中心，到乡镇卫生院最远距离达300多公里，村卫生室会更远一些；而以地级市为中心，到乡镇卫生院最远也就100多公里。省一级公司的大企业配送乡镇卫生院和村卫生室；战线太长、费用太高、亏损不可避免；而相比之下，市县公司配送的距离近、费用小、送货快、效益好的优势充分体现。三是这种配送模式缺乏按市场经济的规律和手段运作，行政干预过度，6000万元至1亿元的销售规模是遴选配送企业的最低门槛，这样一下子就把县级医药公司全部淘汰出局了，极大地浪费了社会资源，违背了市场经济资源配置的原则，给企业的职工就业和社会安定造成不可回避的矛盾。
分散配送
优：自由组合，市场竞争充分
劣：易受“说情风”影响
按照卫生部联合下发的《进一步规范医药机构药品集中采购工作的意见》和《关于建立国家基本药物制度的实施意见》，省级政府组织生产厂家对基本药物进行招标，通过招标确定生产厂家的品种和价格。中标后由生产厂家委托实力强、信誉高、服务好的流通企业进行配送，一般在一个地市委托1~2家企业配送。
分散配送模式的优势在于：一是中标生产厂家为了扩销品种，更大地占领市场份额，会根据多年与流通企业合作共事的经验，实事求是地选择和委托配送企业，配送企业也会充分发挥工作积极性，及时、保质、保量地做好配送工作，两者的利益紧紧地结合在一起，一荣俱荣，一损俱损。二是充分体现了按市场经济规律运作，避免了由政府组织招标遴选配送企业的过度行政干预，彰显了社会公平。但选择委托好配送企业是成败的关键，生产厂家在选择委托配送企业时，一定要坚持标准，不看关系，不能让说情风所动摇，不能被行政部门所操控，要真正把那些优势明显、实力强大、服务优良、送货及时、信誉佳的流通企业选择委托为配送企业，只有这样才能保证配送工作的正常运行。
分级配送
优：优化资源配置，节约成本
劣：缺乏制约，易出现新的垄断
分级配送模式，就是首先由市级医药公司对于中标的基本药物进行统一采购；其次由市级医药公司向县级医院和乡镇卫生院进行配送；再次由市级公司委托县级公司向村卫生室进行配送。术业有专攻，目前还没有任何一家医药企业能够包打天下，完全能够对一个地市所有县、乡、村医疗机构的基本药物全部进行有效的配送。如宝鸡市4家配送企业共承担着12个县区174个乡镇卫生院、1990个村卫生室的基本药物配送任务。实践证明，基本药物配送的重点在乡镇卫生院，难点在村卫生室。市级医药公司向数量少、用量大的县级医院和乡镇卫生院进行配送是非常对路、非常实际、非常匹配的，而向地域广阔、地形各异、交通不便、品规多、用量小的村卫生室进行配送就显得力不从心了，而县级医药公司正好能弥补这块短板，发挥他们距离近、成本低、及时快速的特点，完成好最偏远、最基层的配送任务。
这种分级配送模式的优势在于：一是市级和县级医药公司各自能充分发挥优势，扬长避短，相互促进，共同发展，实现双赢。二是有利于进行资源配置，合理节约社会成本，使县级公司既有所作为，又能更好地满足基层医疗机构的用药需要。但统一采购，分级配送，市县两级医药公司必须诚实守信，遵守合同约定，防止县级公司一旦拿到配送权后，一方面不愿执行统一采购的规定，单独再搞对外采购；另一方面要防止官商作风和新的垄断行为出现。
类别配送
优：资源优势最大化
劣：品种重复，相互打架
药品是个特殊商品，特殊性之一就是品种多、规格多、剂型复杂。据调查统计，陕西省市级医院常用药品达1200多个品种，年用药量达1亿多元；县级医院常用药品达700多个品种，年用药量达近5000万元。为了做好医院的药品配送，保证医疗用药需要，类别配送模式就是按药品不同性质的类别进行配送，即基本药物因国家对其采购、价格、配送、回款、检查、统计等有专门规定，由一个企业专门负责基本药物的配送；常用普通药品由一个企业进行配送；新特药和进口药由一个企业进行配送；麻醉、精神、毒性、放射性等其他特殊药品由一个有相应资质的企业进行配送。
这种分类配送模式的优势在于：一是配送企业能够充分发挥他们的强项，凸显优势，抓好重点，干好专业，把自己最好最强的一面充分展现出来，发挥到极致。二是在合理分工的基础上又有适当竞争，有利于优胜劣汰和资源配置。然而，一个医院同时存在几个配送企业，容易出现品种相互打架的问题，一定要保证合理竞争，特别在配送品种上要划清界限，严格按规范进行操作，要防止在品种上相互冲突和无序竞争，更不能种了别人的地，荒了自己的田，以免影响医院患者的用药需要。