医药电子商务有助于减少流通环节，避免中间环节层层加价，可使采购周期由过去的1—3个月缩短为1—2周，加快资金周转，减少医药库存；同时可让药品流通渠道更为透明。
如何把虚高的药价降下来？这一直是民众关心的话题。近年来，随着医药电子商务的蓬勃发展，这一问题正在逐步得到解决。一项调查显示，一些地区推行医药电子商务后，药价比之前平均下降了20%以上。
近年来，政府因势利导，陆续出台了一系列医药行业发展电子商务的政策法规，为电子商务的发展提供了良好的政策环境。
新医改实施以来，传统医药企业净利越来越薄，使得很多企业将“向互联网融合”作为寻找新利润增长点的出路，纷纷布局电子商务市场。截至2011年11月底，国内获得国家食品药品监督管理局批准的《互联网药品交易服务资格证》的企业达92家，其中向个人消费者提供药品的B2C模式网站49家，用于企业之间交易的B2B模式的网站有34家，第三方医药电子交易服务平台有9家。
电子商务与传统商务相比，拥有着独特的营销魅力与庞大的市场潜力，具有市场全球化、资源集约化、成本低廉化、交易连续化等得天独厚的优势。而大力发展医药电子商务则具有以下益处：
一是有助于减少流通环节，药品直接电子挂牌交易，医疗机构与药品生产企业不受时空限制，生产企业直接挂牌，打破药品购销多级代理体制。药品交易实现了流通环节扁平化，避免了“中间环节”层层加价。电子商务平台集中采购，可使医院医药的采购周期由过去的1—3个月缩短为1—2周，加快资金周转，减少医药库存。
二是医药电子商务让药品流通渠道更为透明，有助于政府强化监管，杜绝假药流入市场。传统交易模式下，同一品种的药品,各单位的购买价格不一,甚至于在不同的地区同种药品出现很大价差，暗箱操作屡禁不止。网上采购具有网上比价、公开交易、竞争采购三大特点，可以使采购价格真正透明化。一旦出现暗箱操作或者假冒伪劣等现象，也可以追根溯源，有效监管。
三是发展医药电子商务有助于细化分工，提高效率。医药电子商务让企业分工更为明确，药品生产企业专注于制造好的产品，物流企业则专注药品流通配送，通过细化行业分工，能够大幅提高配送质量和效率。
当然，作为一个新兴事物，医药电子商务要进一步发展尚缺乏完善的支撑环境，存在各种制约因素，例如行业环境不规范，网购消费者信任度不高；政策门槛高，售药牌照申请难；与医药电子商务相关的法律法规不健全等。
为促进医药电子商务的进一步发展，这些难题亟须破解。可以预见，医药电子商务将为降低药价、加速我国医药产业发展、助推我国医药产业信息化升级转型，作出更多贡献。