首先，佣金制目前一直是本土企业的管理法宝，也是最符合人性的管理手段，也是营销现阶段最符合中国市场的产物。目前大部分的医药销售企业以及国内多数公司对销售人员实施基本工资加销售提成的方式，但具体做法不太一样，多数采取较低的基础工资加上按一定销售比例进行提成的模式。在佣金制的使用上，主要有以下两种方式：
1、单纯佣金制，没有底薪，只按照销售金额进行提成，计算收入。国内目前有多家企业采取此种方式。
2、混合佣金制，有一定的底薪（依据企业的类型及区域有较大出入），此外还有一定比例的销售奖励，目前大多数企业均采取此种方式。
对于佣金制来说，优势是由于报酬明确地同绩效挂钩，因此销售人员为得到更多的工资报酬，会努力扩大销售额，促进企业市场份额的迅速扩大；另外，佣金制由于计算简单，易于为销售人员理解，所以管理和监督成本也比较低。但是在实际的销售工作中，销售人员会依据销售目标的进展情况，有意识的控制销售额的增长，在企业的销售与个人的收入之间采取一种平衡策略。
目前在我国医药市场，许多国内的医药生产机销售企业还将销售完成率、以及销售回笼款额作为与个人工资奖励挂钩的一项重要考核指标。并且会依据市场的发展情况，不断的调整（基本上为增加）销售任务。
但是目前市场的环境下，这种工资支付制度的缺陷是会导致销售人员短期内只注重扩大销售额，同时未了保障自身的收入与销售之间的比例达到一个合理的比值，有意识的控制销售的增长、销售手段的单一、忽视培养长期顾客、不愿推销难以出售的商品等现象的发生。这些只有依靠企业内部合理的市场规划，以及企业针对市场、产品拟定个性化得销售政策，才能帮助企业在销售上取得突破。
佣金制中，最关键的地方主要有两个方面：企业内部的销售政策与销售人员的销售能力；外部销售环境的变化（反商业贿赂，基药，医保等）。企业的管理层必须把控好，并努力采取措施解决内外变化给企业带来的风险，否则由于市场的存在的风险性，而企业最终使风险转嫁到销售人员的身上后，就会有可能造成销售人员收入的忽高忽低，并导致销售队伍的不稳定。
医药行业的佣金制在目前可预见的时期，不会有太大的变化，更多的是在政策上的一些微调或者修订。就目前而言，更可能出现的情况是，销售人员与企业通过一些合理的政策，提升销售人员的忠诚度，相互紧紧的捆绑在一起，共同发展。