医药电商要想打造出行业竞争力，必须从多个方面做好专业化运营，如专业化的物流配送、专业化的服务以及专业化的平台建设等等。
在配送方面，京东好药师在行业首开先河，自建物流配送体系，预计用两年左右的时间完全建好上海、北京、武汉、成都和广州五地的仓储，打造落地配送的完整体系。作为健康产品的药品，安全放在第一位。为了实现药品的快捷、安全配送，京东好药师将形成一个从药品订单到采购，再到配送等各个环节都符合安全质量体系的高效物流配送系统。目前，京东好药师已经具备了一定的行业竞争力：有流量，有快捷配送系统，有安全保障体系。
另一个重要方面是专业化运营。个人认为医药电子商务的经营始终离不开专业化精神。简单来说，医药电子商务的专业化其实就是医药专业化和电子商务专业化。因为有“药品”这个基因，医药电子商务一定是安全至上。“人命关天”的事，只要出了一件事，网站就可能被关掉，所以专业化是这个行业经营的根基。基于互联网的电子商务是完全开放的，但医药行业却并不是完全开放的，是受监管的，这也可以解释为什么医药电商的发展总是没有其他电子商务那么“淋漓尽致”。也正是由于药品要保证安全，经营好医药电商就必须保持医药的专业性和电子商务的专业性。
那么医药的专业性和电子商务的专业性这两者之间的关系如何呢？我个人的观点是两者之间并不是简单叠加的，而是融合的。仔细分析过去的发展，医药电商的一些模式并没有很好地融合。有的过分强调医药的原则性，而贻误了发展的契机；有的则过分强调电子商务的高举高打模式，虽然在短时间内很快吸引了消费者的眼球，但不可持续。现在看来，只有将两者很好地融合，这个行业才具有生命力。
另外必须再次强调的是，网上药店绝不仅仅是药店，而应该是一个平台，因为它不单单满足购药需求，更多的是满足健康需求。而互联网的确是可以充分满足这种需求的场所。消费者通过互联网满足健康需求可以分几步来完成：第一是获取知识武装自己；第二是获得产品使用经验，即看看别人使用这些产品的情况怎么样；第三是提供一些方法，即如果想获得这些药品或者保健品该如何购买，怎样送达。因此，网上药店如果要经营得很好，一定是一个基于用户体验至上，用高科技手段满足用户健康需求的专业化平台。
作为一个刚刚起步的行业，医药电商应紧紧围绕健康生活这个使命，为用户提供丰富的产品、专业的服务、优惠的价格以及快捷的配送和送达服务。就企业的价值观来说，医药电商在符合互联网开放精神的同时，必须符合医药行业本身的专业性。