尽管重重困难有待克服，但是站在新起点上的中医药产业正面临前所未有的发展机遇，在社会、经济等诸多领域的作用也越发显著。
巨大的人口基数，经济增长带动下的城镇化，以及老龄化趋势都给中国医疗卫生带来了毋庸置疑的巨大需求。在新医改和经济发展的刺激下，中国卫生总支出仍处于快速成长期，为中医药产业发展打开空间。尤其是在老龄化趋势明显的背景下，中医药“治未病”的功能将发挥越来越大的作用。中医药“治未病”大致包括“未病先防”和“既病防变”两大方面。“未病先防”是指人体在未病之时，应注意防止疾病的发生，保持身心健康：“既病防变”是指人体在罹患疾病之后，须及时予以控制，阻止病情的不良传变和蔓延。
与此同时，在2003年迎战“非典”、2009年防控甲型H1N1流感和2012年防控人感染H7N9禽流感的系列战役中，中医药发挥了举足轻重的作用。2009年，全球“甲流”来势汹汹，我国“甲流”病人的死亡率是十万分之十，同期美国的死亡率是十万分之二百五十，疫苗接种和中医药的大量使用是促使我国甲流防控工作取得显著成效的重要原因。2012年，H7N9禽流感疫情爆发，国家卫计委将“莲花清瘟胶囊”等中药产品列入防控疫情的“药单”名录。
“在新的形势之下，我们需要及时调整经营思路，加速生产现代化的升级。”同仁堂总经理高振坤表示，2010年至今同仁堂已经进入了“先规范后发展”的第三个发展阶段。同仁堂之所以在产业需求旺盛的情况下，更加突出生产和经营规范化，主要源于企业对“做长、做强、做大”传统理念的传承，品牌和文化始终是同仁堂长久发展的核心和精髓，通过“做长”维护品牌，进而实现“做强”、“做大”的长期目标。
目前，同仁堂生产400多种产品，还不到该公司拥有批准文号的一半，随着市场规模不断扩大，产品供货日渐紧张。于是，同仁堂在现有六大生产基地的基础上，正在投资建设170亩的大兴综合产业园，预计2014年底建成后，随着生产设备自动化程度的提高，同仁堂产能将大大提高，设计产能可以满足“十三五”期间的发展需求。
同仁堂拥有800多个产品的批准文号，产能不可能满足全部产品的生产。由于炮制严谨、标准严格，同仁堂无形中成本提高很多，在药品国家定价的情况下，对于一些微利甚至赔本的产品以满足市场基本需求为原则适量生产，同时大力发展主导产品，并培育有市场潜力的产品。目前，同仁堂年销售额过亿元的主导品种包括安宫牛黄丸、牛黄清心丸、六味地黄丸、大活络丸、乌鸡白凤丸和国公酒等。
医药营销体系一直被认为是同仁堂的“短板”。同仁堂董事长梅群表示，今年6月1日新版GSP的正式实施，将会推动优势资源向规模企业和规范企业方面集中，届时有望给予优势医药零售企业以扩大规模、完善网络、做大市场的机遇，可在很大程度上加快行业集中度的提升。因此，同仁堂未来将把大力发展零售渠道作为主攻方向之一。自2003年至今，同仁堂的营销改革从未止步，2011年成功完成了对同仁堂商业的资产重组后，通过控股同仁堂商业，至2012年末公司自有门店数量超过370家。同仁堂还积极拓展海外市场，在海外16个国家和地区开设了87家零售药店。