2013年11月，党的十八届三中全会发布《中共中央关于全面深化改革若干重大问题的决定》，为国企深化改革拉开了序幕。业内人士认为，目前国内医药行业主体和领导企业还是国有企业。进行混合所有制改革，可以避免单一产权结构下的诸多问题，盘活国有资产，提升其市场价值。
据Wind数据，实际控制人为国务院国有资产监督管理委员会的A股医药行业上市公司包括：华润旗下华润三九、华润双鹤、东阿阿胶、华润万东，国药系包括国药股份、国药一致、天坛生物、现代制药，通用系下中国医药。此外，实际控制人为地方国有资产监督管理委员会等相关部门的上市药企包括上海医药、白云山、云南白药、华北制药、哈药股份等40家，另外还有5家高校企业，包括北大医药、交大昂立、紫光古汉、山大华特、达安基因。
数据显示，2014年前三季度，这54家国企实现净利润为131.18亿元，而同期188家上市药企总计实现利润378.25亿元。这意味着54家国字药企实现的净利润仅占该行业上市公司利润总和的34%。如何盘活这类企业的营运能力仍是市场关注的焦点。
2014年7月15日，国务院国资委通报了关于国资国企改革试点的有关情况。根据试点工作需要，国资委选择了中国医药集团总公司(简称：国药集团)作为发展混合所有制经济试点和董事会行使高级管理人员选聘、业绩考核和薪酬管理职权试点。据了解国药集团旗下A股上市公司国药股份、国药一致、天坛生物、现代制药这四家上市公司。
国药集团表示，已经实现混合所有制的子企业，要在股权层面改革的基础上，进一步完善公司的法人治理结构，完善激励和约束相结合的管理体制。此外，要加快推进集团内没有实现混合所有制改革全资子企业尽快改革。通过这次试点，激发企业的活力和市场竞争力，保障企业按市场规则独立自主经营，保障国有资产的保值增值。
相关人士透露，国药集团已经对部分二级公司进行了股份制改造，改进了企业法人治理结构。国药集团旗下非上市公司或将成为重点。据了解，国药集团旗下还有11家非上市公司，包括中国生物技术股份有限公司、中国医药工业研究总院、中国国际医药卫生公司、中国科学器材公司等。
值得注意的是，除了资产注入的预期外，市场预期国字药企进行整合的可能性很大，而先前这类案例并不少。如通用系(中国通用技术控股集团)旗下两家上市公司天方药业和中国医药已经完成合并，中国医药将作为通用旗下医药资产的整合平台。华润集团曾欲整合旗下医药资产，筹划华润双鹤、华润三九资产重组。虽然此项重组最终告吹，却对外透露了一个讯息，那就是华润集团旗下资产仍有整合可能。
此外，2013年，广州市国有资产监督管理委员会旗下两大医药上市公司广州药业和白云山进行合并，欲打造千亿级龙头企业;重庆市涪陵区国有资产监督管理委员会旗下三家上市公司太极集团、西南药业、桐君阁之间的整合也引起市场广泛关注。