“新农合作为农村居民的一项基本医疗保障制度，目前已经实现了广覆盖。‘十二五’期间，在筹资水平不断提高的情况下，要强化新农合的风险保护机制，并与医疗救助有效衔接，使重特大疾病补偿水平达到90%左右。并要逐步将20种重大疾病纳入保障范围。”陈竺在2012年全国卫生工作会议上表示。
记者在会上了解到，今年将继续提高新农合保障水平。在巩固覆盖率的同时，新农合的筹资标准提高到人均300元左右，政策范围内住院费用报销比例达到75％左右，最高支付限额不低于农民人均年收入的8倍，且不低于6万元。普遍开展门诊统筹，建立重特大疾病保障基金，扩大覆盖病种范围，推动支付方式改革，探索提高新农合统筹层次、商业保险机构参与经办服务等。
陈竺指出，随着筹资水平不断提高，“十二五”期间，要把增强对农民健康的风险保护作为巩固完善制度的突出重点，在普遍提高参合农民受益程度的基础上，作出有效制度安排，建立稳定的重特大疾病保障机制。2012年，政府对新农合的补助将提高到240元，各地区要从新增资金中划出一定比例，建立省级统筹基金，用于重特大疾病保障，并与医疗救助有效衔接，使重特大疾病补偿水平达到90%左右。年底前全面实施儿童白血病、先心病，妇女乳腺癌、宫颈癌等8个病种的大病保障。还要在三分之一左右的统筹地区，将肺癌、食道癌、胃癌、结肠癌、直肠癌、慢性粒细胞白血病、急性心肌梗塞、脑梗死、血友病、1型糖尿病、甲亢、唇腭裂等12种疾病纳入保障范围。同时通过实施规范化治疗，做好费用控制。要探索利用商业保险形成多重补充保险机制，分担重特大疾病高额医疗费用。各地要积极协调财政、民政等部门，落实上述任务，最大限度地降低参保群众的灾难性医疗支出，防止因病致贫、返贫。
据了解，2011年，新农合覆盖面持续扩大，筹资水平大幅提高，保障水平继续提升，管理水平不断改善。各地在推进新农合工作中不断探索出一些创新做法：江西、江苏、辽宁、河北、山东、重庆、安徽、湖南、湖北、海南等省（区、市）重特大疾病保障增加了中末期肾病等病种，吉林扩展到20种疾病；新疆、云南、西藏、青海、福建、湖南等地开展重特大疾病补充保险或购买商业保险试点；江苏常熟、湖南蓝山等开展支付方式改革；内蒙古和陕西探索将统筹层次提高到市（盟）级；广东、河南、湖南等地探索商业保险机构经办新农合管理；江苏以立法形式建立了新农合筹资稳定增长机制。