审计署审计长刘家义12月28日的全国审计工作会议上，加强对教育、医疗等民生资金和项目的审计，同时2016年审计署将组织全国审计机关对基本医疗保险基金和医疗救助资金进行审计。
从国家审计署2012对社保资金的审计来看，药企和医院都将成为审计的重点。在2012年审计报告中，国家审计署指出：
部分单位和个人违规牟取不正当利益。有4家药品经销企业通过虚开增值税发票6.76亿元，虚增药品成本牟取非法利益；6个省本级、75个市本级和226个县的医疗机构等单位通过虚假发票、虚假病例、挂床住院、滥开药物、虚报人数等手段套取医保资金2.87亿元；部分医疗机构采取违规加价等方式乱收费1.94亿元……本次审计查出违法违纪案件线索132起，涉及300多人，对上述案件线索，审计机关已依法移送相关部门或地方政府进一步查处。
审计部门对药企税务核查之威，在审计署最近的公告中已经提及，15家药企因虚开增值税发票偷逃税款18.5亿，被罚22.29亿，有关责任还被处以7年至12年的有期徒刑。最新的一则案例是，嘉峪关的一家商业公司因虚开1855万多元的发票，当地法院判处该公司法定代表人有期徒刑12年，该公司出纳凡某因犯同罪被判处缓刑5年。
除了药企外，医院更是审计的重点，预计全国公立医院在卫计委的医疗反腐巡查之外，还将接受审计署对其如何使用医保资金的巡查。如果说卫计委是医院主管部门，相对还会手下容情的话，，那么审计署可是以严厉著称，估计在2016年，各级医院，尤其是基层的不少公立医院面临核查和整肃。
审计署神核查药企核查重点是虚开增值税发票和偷逃税款两大重点，相关案例内容可参见严查票据，药商被罚巨款、判刑！
而对于医院的核查重点，四川省去年对医保资金进行过专项核查，透露了对医院核查的重点：各审计组均将医院重复收费、违规加价等问题列为审计重点进行审计。另外，各审计组还重点关注了医疗机构及个人骗取医保基金、扩大范围报销医保基金等问题。
部分定点医院通过违反医疗器械、药品价格政策加价收费，多记诊疗服务量，超范围报销医保基金等方式多报销医保基金等问题，部分定点医院通过虚假治疗、虚假住院，涉嫌骗取医保基金的问题在核查中被查出。